研究者情報 - 坂本　卓也

（最終更新日：2024-07-15 00:38:58）

  サカモト　タクヤ   Sakamoto Takuya
  坂本　卓也
   所属   神奈川大学理学部理学科

神奈川大学大学院理学研究科理学専攻（生物科学領域）

職種准教授

■ 専門分野

植物分子生物学, 植物クロマチン生物学　（キーワード：環境ストレス、植物栄養、DNA損傷、染色体構造、エピジェネティクス、塊根発生）

■ 学位等

博士（農学）

■ 著書・論文歴

1.	著書	植物におけるエピジェネティクス状態の可視化技術アグリバイオ 3,28-32頁（共著） 2019/02
2.	著書	Cell division and cell growth Molecular cell biology of the growth and differentiation of plant cells edited by Ray Rose pp.86-98 （共著） 2016/07
3.	論文	Plant chromosome polytenization contributes to suppression of the root growth in high-polyploids Journal of Experimantl Botany erae288 （共著） 2024/07
4.	論文	A chromosome-level genome assembly for the amphibious plant Rorippa aquatica reveals its allotetraploid origin and mechanisms of heterophylly upon submergence Communications Biology 7,pp.431 （共著） 2024/04
5.	論文	Nuclear pore complex proteins are involved in centromere distribution iScience 27,pp.108855 （共著） 2024/01
6.	論文	Analysis of Chromatin Accessibility, Histone Modifications, and Transcriptional States in Specific Cell Types Using Flow Cytometry In: Kaufmann, K., Vandepoele, K. (eds) Plant Gene Regulatory Networks. Methods in Molecular Biology 2698,pp.55-73 （共著） 2023/09
7.	論文	Chromatin dynamics and subnuclear gene positioning for transcriptional regulation Current Opinion in Plant Biology 75,pp.102431 （共著） 2023/08
8.	論文	The plant nuclear lamina disassembles to regulate genome folding in stress conditions Nature Plants （共著） 2023/07
9.	論文	NAC103 mutation alleviates DNA damage in an Arabidopsis thaliana mutant sensitive to excess boron Frontiers in Plant Science （共著） 2023/03
10.	論文	Histone deacetylation regulates de novo shoot regeneration PNAS Nexus 2,pp.pgad002 （共著） 2023/02
11.	論文	Genomic analysis of an ultrasmall freshwater green alga, Medakamo hakoo Communications Biology 6,pp.89 （共著） 2023/01
12.	論文	Novel whole-mount FISH analysis for intact root of Arabidopsis thaliana with spatial reference to 3D visualization Journal of Plant Research （共著） 2023/01
13.	論文	A mechanism regulating centromere distribution in Arabidopsis thaliana Nature Plants 8,pp.877-878 （共著） 2022/08
14.	論文	Two-step regulation of centromere distribution by condensin II and the nuclear envelope proteins Nature Plants 8,pp.940-953 （共著） 2022/08
15.	論文	Sustained defense response via volatile signaling and its epigenetic transcriptional regulation Plant Physiology 189,pp.922-933 （共著） 2022/06
16.	論文	Brain Angiopathy and Impaired Glucose Logistics in Mice with Psychosis-related Higher Brain dysfunction Science Advances 7,pp.46 （共著） 2021/11
17.	論文	Components of the Nuclear Pore Complex are Rising Stars in the Formation of a Subnuclear Platform of Chromatin Organization beyond Their Structural Role as a Nuclear Gate Cytologia 86,pp.183-187 （共著） 2021/09
18.	論文	A live imaging system to analyze spatiotemporal dynamics of RNA polymerase II modification in Arabidopsis thaliana Communications Biology 4,pp.580 （共著） 2021/05
19.	論文	Next generation sequence-based technologies for analyzing DNA strand breaks Cytologia 86,pp.33-39 （共著） 2021/03
20.	論文	Roles of BRAHMA and its interacting partners in plant chromatin remodeling Cytologia 85,pp.263-267 （共著） 2020/12
21.	論文	Visualization of extracellular vesicles in the regenerating caudal fin blastema of zebrafish using in vivo electroporation Biochemical and Biophysical Research Communications 533,pp.1371-1377 （共著） 2020/12
22.	論文	The mechanisms and significance of the positional control of centromeres and telomeres in plants Journal of Plant Research 133,pp.471-478 （共著） 2020/05
23.	論文	Toward an understanding of nuclear substructures beyond their classical functions Journal of Plant Research 133,447-448頁（共著） 2020/05
24.	論文	Cyanidioschyzon merolae aurora kinase phosphorylates evolutionarily conserved sites on its target to regulate mitochondrial division Communications Biology 2,pp.477 （共著） 2019/12
25.	論文	過剰なホウ素はなぜ毒となるのか？：ホウ素毒性の分子機構に迫る Plant Morphology 31,53-59頁（共著） 2019/09
26.	論文	Intracellular localization of histone deacetylase HDA6 in plants Journal of Plant Research 132,pp.629-640 （共著） 2019/07
27.	論文	Abnormal leaf development of rpt5a mutant under zinc deficiency reveals important role of DNA damage alleviation for normal leaf development Scientific Reports 9,pp.9369 （共著） 2019/06
28.	論文	Plant condensin II is required for the correct spatial relationship between centromeres and rDNA arrays Nucleus 10,pp.116-125 （共著） 2019/05
29.	論文	The 26S proteasome is required for the maintenance of root apical meristem by modulating auxin and cytokinin responses under high-boron stress Frontiers in Plant Science 10,pp.590 （共著） 2019/05
30.	論文	Primed histone demethylation regulates shoot regenerative competency Nature Communications 10,pp.1786 （共著） 2019/04
31.	論文	SMC5/6 Complex Subunit NSE4A is Involved in DNA Damage Repair and Seed Development in Arabidopsis The Plant Cell 31,pp.1579-1597 （共著） 2019/04
32.	論文	Poteasomal degradation of BRAHMA promotes Boron tolerance in Arabidopsis Nature Communications 9,pp.5285 （共著） 2018/12
33.	論文	Auxin decreases chromatin accessibility through the TIR1/AFBs auxin signaling pathway Scientific Reports 8,pp.7773 （共著） 2018/05
34.	論文	Acetate-mediated novel survival strategy against drought in plants Nature Plants 3,pp.17119 （共著） 2017/06
35.	論文	A plant ancestral polo-like kinase sheds light on the mystery of the evolutionary disappearance of polo-like kinases in the plant kingdom Cytologia 82,pp.261-266 （共著） 2017/06
36.	論文	Hi-C revolution: from a snapshot of DNA-DNA interaction in a single cell to chromosome-scale de novo genome assembly Cytologia 82,pp.223-226 （共著） 2017/06
37.	論文	Live imaging of H3K9 acetylation in plant cells Scientific Reports 7,pp.45894 （共著） 2017/04
38.	論文	植物のヒストン修飾ライブイメージング Plant Morphology 29,3-7頁（共著） 2017/04
39.	論文	Plant Aurora kinases interact with and phosphorylate transcription factors Journal of Plant Research 129,pp.1165-1178 （共著） 2016/11
40.	論文	Dynamics of plant DNA replication based on PCNA visualization Scientific Reports 6,pp.29657 （共著） 2016/07
41.	論文	TPR5 is involved in cell cycle progression and is essential for the maintenance of meristem cell organisation in Arabidopsis thaliana Journal of Experimental Botany 67,pp.2401-2411 （共著） 2016/03
42.	論文	Difference in cesium accumulation in rice grown in the paddy field in the Fukushima-city in the years of 2011 and 2012 Journal of Plant Research 127,pp.57-66 （共著） 2014/01
43.	論文	New insights into the dynamics of plant cell nuclei and chromosomes International Review of Cell and Molecular Biology 305,pp.253-351 （共著） 2013/08
44.	論文	Boron eLS: Citable Reviews in the Life Sciences （単著） 2012/05
45.	論文	Low-affinity cation transporter (OsLCT1) regulates cadmium transport into rice grains Proceedings of the National Academy of Sciences of USA 108,pp.20959-20964 （共著） 2011/12
46.	論文	Condensin II Alleviates DNA Damage and Is Essential for Tolerance of Boron Overload Stress in Arabidopsis thaliana The Plant Cell 22,3533-3546頁（共著） 2011/09
47.	論文	Arabidopsis thaliana 26S proteasome subunits RPT2a and RPT5a are crucial for Zinc deficiency-tolerance Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 75,pp.561-567 （共著） 2011/03
48.	論文	Contributions of apoplasmic cadmium accumulation, antioxidative enzymes and induction of phytochelatins in cadmium tolerance of the cadmium-accumulating cultivar of black oat (Avena strigosa Schreb.) Planta 230,pp.267-279 （共著） 2009/07
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■ 学会発表

1.	2024/06/17	Function of condensin II in the maintenance of genome stability（Plant Genome Stability and Change 2024）
2.	2024/06/15	Analysis of a blue light receptor CRY1 during plant regeneration（⽇本メンデル協会第１回⼤会（東京⼤会））
3.	2024/06/15	植物のシュート再生に関与するプライミング複合体の機能解析（⽇本メンデル協会第１回⼤会（東京⼤会））
4.	2024/06/15	植物細胞における適切なセントロメア配置の形成機構と意義の解析（⽇本メンデル協会第１回⼤会（東京⼤会））
5.	2024/06/15	シロイヌナズナの様々なエコタイプにおけるセントロメア配置の解析（⽇本メンデル協会第１回⼤会（東京⼤会））
6.	2024/06/15	シロイヌナズナにおける重イオンビーム誘発ゲノム再編成の構造決定（⽇本メンデル協会第１回⼤会（東京⼤会））
7.	2024/05	植物の器官全体を対象としたwhole-mount FISHによる染色体動態と細胞成長の関連の解析（中国四国地区　生物系三学会合同大会　2024年度岡山大会）
8.	2024/03/01	Analysis of a blue light receptor CRY1 during plant regeneration（第65回日本植物生理学会年会）
9.	2024/03/01	Comprehensive analysis of a chromatin remodeling factor involved in shoot regeneration in plants（第65回日本植物生理学会年会）
10.	2024/03/01	Exploring interacting factors with a histone demethylase LDL3（第65回日本植物生理学会年会）
11.	2024/03/01	Functional analysis of cohesin in the formation of chromosomal higher- order structure in Cyanidioschyzonmerolae（第65回日本植物生理学会年会）
12.	2023/12/01	動物と植物のハイブリッドゲノムの動態を明らかにする（第46回日本分子生物学会年会）
13.	2023/12/01	植物の核膜孔複合体はセントロメア配置制御に関与する（第46回日本分子生物学会年会）
14.	2023/10/01	Arabidopsis histone remodeling system: insight from HAC1/HDA6/TPL(R) in response to Spodoptera litura damage（東京理科大学生物環境イノベーション研究部門公開シンポジウム）
15.	2023/10/01	シロイヌナズナ塊根様組織iMOの形成に関与するDOF転写因子の同定（東京理科大学生物環境イノベーション研究部門公開シンポジウム）
16.	2023/10/01	シロイヌナズナの塊根様組織形成に関与するクロマチンリモデリング因子の同定（東京理科大学生物環境イノベーション研究部門公開シンポジウム）
17.	2023/10/01	イネの種子登熟過程におけるオートファジーを介したαアミラーゼの発現制御機構（東京理科大学生物環境イノベーション研究部門公開シンポジウム）
18.	2023/09/01	ASHH2 における植物再生能獲得に関与するエピジェネティックな制御機構の解析（日本植物学会第87回大会）
19.	2023/09/01	ASHH2 における植物再生能獲得に関与するエピジェネティックな制御機構の解析（日本植物形態学会第35回大会）
20.	2023/09/01	γ線照射によるシュート再生能力向上の分子メカニズム解析（日本植物形態学会第35回大会）
21.	2023/09/01	シロイヌナズナにおけるヒストン修飾 H3K4me3 のライブイメージング系の開発（日本植物学会第87回大会）
22.	2023/09/01	ゲノム倍数体における細胞サイズと染色体動態の関連について（サイズ生物学ワークショップ2023）
23.	2023/09/01	家の水槽にいた微細藻類・メダカモは淡水産緑藻で最少遺伝子数をもつ新種藻類であった（日本植物学会第87回大会）
24.	2023/09/01	核膜孔複合体はシロイヌナズナのセントロメア二段階配置制御に関与する（日本植物学会第87回大会）
25.	2023/09/01	核膜孔複合体はセントロメア二段階配置制御に関与する（日本植物形態学会第35回大会）
26.	2023/09/01	植物のシュート再生能力獲得に関与するエピジェネティック制御因子の機能解析（日本植物形態学会第35回大会）
27.	2023/09/01	植物のシュート再生能力獲得に関与するヒストンメチル化酵素の機能解析（日本植物学会第87回大会）
28.	2023/09/01	植物の再生過程に関わるクロマチンリモデリング因子の機能解明（日本植物学会第87回大会）
29.	2023/09/01	植物の新規シュート再生系におけるクロマチンリモデリング因子の機能解析（日本植物形態学会第35回大会）
30.	2023/09/01	特定条件下でみられるシロイヌナズナ塊根様組織の形成に関わる因子の探索（日本植物学会第87回大会）
31.	2023/09/01	ガンマ線照射によるシュート再生能力向上のメカニズム解析（日本植物学会第87回大会）
32.	2023/09/01	ヒストン脱メチル化酵素LDL3のカルスにおける機能解析（日本植物形態学会第35回大会）
33.	2023/09/01	エピジェネティック・プライミング複合体の同定と解析（日本植物学会第87回大会）
34.	2023/08/01	Fate of diterpenoid phytoalexins: from induced biosynthesis to degradation（TERPNET 2023 meeting）
35.	2023/07/01	イネ異種染色体添加系統のゲノム構造と3Dゲノム構造（イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ）
36.	2023/06/01	Analysis of a blue light receptor CRY1 during plant regeneration（The 33rd International Conference on Arabidopsis Research）
37.	2023/06/01	Analysis of a nuclear lamina protein CRWN and its interacting proteins（The 33rd International Conference on Arabidopsis Research）
38.	2023/06/01	Analysis of the effect of autopolyploidization on root growth in Arabidopsis thaliana with spatial reference to high-ploidy syndrome（The 33rd International Conference on Arabidopsis Research）
39.	2023/06/01	ASHH2 regulates plant regeneration through regulation of photosynthesis and glucose metabolic pathways（The 33rd International Conference on Arabidopsis Research）
40.	2023/06/01	Epidermal Cell Type-Specific Chromatin Dynamics Underlying Arabidopsis Heat Stress Memory（The 33rd International Conference on Arabidopsis Research）
41.	2023/06/01	Exploring the mechanisms and significance of centromere distribution in plants（Plant Science for Beautiful World: Real Dynamics of Plant Chromosomes）
42.	2023/06/01	Functional analysis of a chromatin remodeling factor involved in the process of plant regeneration（The 33rd International Conference on Arabidopsis Research）
43.	2023/06/01	Functional analysis of histone methyltransferase required for shoot regeneration（The 33rd International Conference on Arabidopsis Research）
44.	2023/06/01	Live-cell imaging of H3K4me3 in Arabidopsis thaliana（The 33rd International Conference on Arabidopsis Research）
45.	2023/06/01	Mechanistic analysis of the improvement of shoot regeneration ability by gamma irradiation（The 33rd International Conference on Arabidopsis Research）
46.	2023/06/01	Regulatory mechanisms and roles of centromere arrangement in Arabidopsis thaliana（The 33rd International Conference on Arabidopsis Research）
47.	2023/06/01	The nuclear pore complex is involved in the two-step regulation of centromere arrangement in Arabidopsis thaliana（The 33rd International Conference on Arabidopsis Research）
48.	2019/12	Involvements of nuclear pore complex proteins in the regulation of spatial arrangement of chromatin domains in Arabidopsis（SEB conference on "Impact of chromatin domains on plant phenotypes"）
49.	2018/09	Maintenance of chromatin stability brought by two-step regulation of centromere distribution（日本植物学会第82回大会）
50.	2018/03	The formation of tuberous roots by activation of stem cell proliferation in Arabidopsis thaliana（第59回日本植物生理学会年会）
51.	2017/11	Mutations in 26S proteasome subunits cause tuberous root formation under the stress condition in Arabidopsis thaliana（Taiwan-Japan 2017 Plant Biology Conference）
52.	2017/06	Regulation of centromere positioning by condensin II in collaboration with nuclear envelope proteins in Arabidopsis（European Workshop for Plant Chromatin 2017）
53.	2015/03	Maintenance of chromatin stability as a basis for environmental response（第56回日本植物生理学会年会）
54.	2013/06	Isolation and characterization of novel Arabidopsis mutants hypersensitive to excess boron（Boron 2013）
55.	2009/08	Isolation of Arabidopsis thaliana mutants sensitive to excess boron（The International Plant Nutrition Colloquium XVI）
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■ 職歴

1.	2023/04～	東京理科大学客員准教授
2.	2020/05～	東京大学大学院新領域創成科学研究科・松永研究室客員連携研究員
3.	2020/04～2023/03	東京理科大学理工学部応用生物科学科嘱託講師
4.	2018/04～	東京都医学総合研究所協力研究員
5.	2015/04～2020/03	東京理科大学理工学部応用生物科学科嘱託助教
6.	2014/04～2015/03	東京理科大学理工学部・松永研究室日本学術振興会特別研究員（PD)
7.	2011/09～2014/03	東京理科大学理工学部・松永研究室ポストドクトラル研究員
8.	2011/04～2011/08	東京大学大学院農学生命科学研究科・植物栄養肥料学研究室特任研究員
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■ 研究課題・受託研究・科研費

1.	2023/07～2028/03	植物におけるセントロメア配置の生物学的意義の探索その他の補助金・助成金
2.	2023/04～2027/03	植物におけるnon-Rabl構造形成の分子基盤と意義の解明基盤B
3.	2023/04～2025/03	植物におけるホウ素によるクロマチンプラットフォーム構築仮説の検証挑戦的研究（萌芽）
4.	2022/04～2024/03	イモを作らない植物を用いたイモの形成を制御する新規因子の同定と機能解析その他の補助金・助成金
5.	2022/04～2027/03	植物再生を制御する転写待機メカニズムの分子基盤解明基盤A
6.	2021/04～2023/03	植物のDNA損傷応答及び再生現象における染色体三次元構造制御の意義の解明その他の補助金・助成金
7.	2020/04～2022/03	再分化をもたらす変調を制御する遺伝子プライミングメカニズムの解明新学術領域研究
8.	2020/04～2022/03	植物のホウ素過剰害耐性に関わる26Sプロテアソーム新規機能の解明その他の補助金・助成金
9.	2020/04～2022/03	植物におけるセントロメア配置の生物学的意義の探索その他の補助金・助成金
10.	2019/04～2022/03	細胞種特異的ヒストン修飾解析系を用いた脱分化をもたらすエピジェネテクスの解明基盤C
11.	2019/04～2021/04	非塊根形成植物シロイヌナズナを用いた塊根形成メカニズムの解明その他の補助金・助成金
12.	2015/04～2018/03	葉の発生ロジックの多元的開拓新学術領域研究
13.	2014/04～2015/03	染色体の各内配置制御メカニズムの解明特別研究員奨励費
14.	2012/04～2014/03	植物におけるコンデンシンを含むDNA損傷応答モデルの確立研究活動スタート支援
15.	2009/04～2009/04	ホウ素はなぜ毒となるのか―シロイヌナズナのホウ素過剰毒性における26Sプロテアソームの機能解析― その他の補助金・助成金
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■ 受賞学術賞

1.	2023/09	日本メンデル協会第9回　CYTOLOGIA奨励賞
2.	2019/09	日本植物形態学会日本植物形態学会　平瀬賞
3.	2019/03	Japan-Taiwan Plant Biology Japan-Taiwan Plant Biology 2019 Presentation award (植物における熱ストレスに対する記憶形成機構に関する研究)
4.	2018/09	日本植物形態学会日本植物形態学会　奨励賞
5.	2017/11	Taiwan-Japan Plant Biology 2017 Short talk award (シロイヌナズナを用いた塊根形成機構に関する研究)
6.	2016/09	日本植物学会第80回大会日本植物学会第80回大会　最優秀ポスター賞 (原始紅藻シゾンにおけるオーロラキナーゼによるミトコンドリア分裂機構に関する研究)
7.	2014/09	日本土壌肥料学会2014年度東京大会日本土壌肥料学会2014年度東京大会　ポスター賞 (植物のホウ素過剰障害におけるDNA損傷軽減機構に関する研究)
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■ 科研費研究者番号

40637691